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加快打造原始創(chuàng)新策源地,加快突破關(guān)鍵核心技術(shù),努力搶占科技制高點(diǎn),為把我國(guó)建設(shè)成為世界科技強(qiáng)國(guó)作出新的更大的貢獻(xiàn)。

——習(xí)近平總書記在致中國(guó)科學(xué)院建院70周年賀信中作出的“兩加快一努力”重要指示要求

面向世界科技前沿、面向經(jīng)濟(jì)主戰(zhàn)場(chǎng)、面向國(guó)家重大需求、面向人民生命健康,率先實(shí)現(xiàn)科學(xué)技術(shù)跨越發(fā)展,率先建成國(guó)家創(chuàng)新人才高地,率先建成國(guó)家高水平科技智庫(kù),率先建設(shè)國(guó)際一流科研機(jī)構(gòu)。

——中國(guó)科學(xué)院辦院方針

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生物物理所開發(fā)單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析可視化平臺(tái)

2019-11-15 生物物理研究所
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  單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)是一種在單細(xì)胞水平上對(duì)基因組、轉(zhuǎn)錄組、表觀組等進(jìn)行高通量測(cè)序分析的技術(shù)。單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)能夠在組學(xué)水平揭示細(xì)胞間的異質(zhì)性。單細(xì)胞水平細(xì)胞譜系追蹤技術(shù)位居2018年Science 雜志評(píng)選的十大科學(xué)突破之首。常規(guī)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)丟失了細(xì)胞在原組織中至關(guān)重要的空間位置信息,而單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)在進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的同時(shí)保留并記錄了細(xì)胞的空間位置信息??臻g轉(zhuǎn)錄組技術(shù)能夠揭示細(xì)胞間的相互作用以及細(xì)胞所處的微環(huán)境,將成為發(fā)育生物學(xué)、神經(jīng)生物學(xué)、免疫生物學(xué)、腫瘤微環(huán)境等領(lǐng)域的研究利器。

  11月12日,《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在線發(fā)表了中國(guó)科學(xué)院生物物理研究所高通量測(cè)序中心題目為SpatialDB: a database for spatially resolved transcriptomes 的論文,發(fā)布第一個(gè)單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)及數(shù)據(jù)在線可視化平臺(tái)。SpatialDB系統(tǒng)收錄了來自5個(gè)物種由8種空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)產(chǎn)生的數(shù)據(jù),建立了空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析處理流程,實(shí)現(xiàn)了空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的在線可視化,同時(shí)提供了空間差異表達(dá)基因及其功能富集分析的注釋。

  中科院院士、生物物理所研究員陳潤(rùn)生以及高級(jí)工程師陳小偉為論文共同通訊作者。生物物理所高通量測(cè)序中心高級(jí)工程師范珍為論文第一作者。該研究獲得中科院關(guān)鍵技術(shù)人才項(xiàng)目、國(guó)家自然科學(xué)基金和國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)項(xiàng)目的資助。

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生物物理所開發(fā)單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析可視化平臺(tái)

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