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加快打造原始創(chuàng)新策源地,加快突破關(guān)鍵核心技術(shù),努力搶占科技制高點(diǎn),為把我國建設(shè)成為世界科技強(qiáng)國作出新的更大的貢獻(xiàn)。

——習(xí)近平總書記在致中國科學(xué)院建院70周年賀信中作出的“兩加快一努力”重要指示要求

面向世界科技前沿、面向經(jīng)濟(jì)主戰(zhàn)場、面向國家重大需求、面向人民生命健康,率先實(shí)現(xiàn)科學(xué)技術(shù)跨越發(fā)展,率先建成國家創(chuàng)新人才高地,率先建成國家高水平科技智庫,率先建設(shè)國際一流科研機(jī)構(gòu)。

——中國科學(xué)院辦院方針

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【中國科學(xué)報】犬科動物數(shù)據(jù)庫iDog正式上線

2018-11-12 中國科學(xué)報 沈春蕾 張湘泉
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語音播報

  近日,由中國科學(xué)院昆明動物所與北京基因組所合作開發(fā)的犬科動物數(shù)據(jù)庫iDog正式上線。該項(xiàng)研究成果在國際學(xué)術(shù)期刊《核酸研究》在線發(fā)表。中科院昆明動物研究所研究員王國棟和北京基因組研究所正高級工程師趙文明為共同通訊作者。

  家犬毫無爭議是人類最好的朋友之一,同時也是許多人類遺傳病的基礎(chǔ)研究模型。王國棟介紹,iDog 是第一個家犬與野生犬科動物整合性資源數(shù)據(jù)庫,它不僅提供了豐富的組學(xué)數(shù)據(jù)、基因組拼接數(shù)據(jù)、基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)、犬類疾病及相關(guān)表型信息,還整合了序列比對工具用于線上數(shù)據(jù)分析,以及基因組瀏覽器用于數(shù)據(jù)可視化。iDog的建立不僅有利于全球范圍內(nèi)犬科動物的研究,還為大量的愛狗人士提供了一個用戶友好的界面查找相關(guān)寵物狗信息。

  據(jù)悉,iDog具有良好的可拓展性和持續(xù)性等特點(diǎn),其包含的主要模塊有基于127個家犬樣本基因組重測序數(shù)據(jù)產(chǎn)生的變異信息數(shù)據(jù)庫、含有32220個基因的犬科動物基因數(shù)據(jù)庫、基于RNA-Seq測序數(shù)據(jù)的基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫、犬科動物相關(guān)疾病的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫、人—狗疾病同源信息數(shù)據(jù)庫、犬科動物基因組拼接數(shù)據(jù)庫等。iDog計劃后續(xù)整合更多的組學(xué)數(shù)據(jù),在Dog10K項(xiàng)目的背景下,持續(xù)更新高質(zhì)量的數(shù)據(jù)集,逐步轉(zhuǎn)化成犬科動物基礎(chǔ)研究的信息知識寶庫。

 ?。ㄔd于《中國科學(xué)報》 2018-11-12 第5版 創(chuàng)新周刊)

打印 責(zé)任編輯:侯茜

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