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隨全球人口老齡化程度加劇,實現(xiàn)健康老齡化是目前亟待解決的社會問題和科學問題。近年來,隨衰老相關研究成果不斷增多及高通量測序技術日益發(fā)展,衰老相關多組學數(shù)據(jù)逐漸增多。然而目前,尚缺乏一個綜合性的、整合衰老生物學多組學數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)資源庫。
中國科學院北京基因組研究所(國家生物信息中心)研究員鮑一明研究組、研究員張維綺研究組和中科院動物研究所研究員劉光慧研究組、研究員曲靜研究組,合作建立Aging Atlas數(shù)據(jù)庫。該數(shù)據(jù)庫從常規(guī)轉錄組、單細胞轉錄組、表觀基因組、蛋白質組及藥物基因組等層面,整合衰老相關數(shù)據(jù)集,實現(xiàn)不同條件下基因表達調控隨衰老變化趨勢的匯聚融合。該數(shù)據(jù)庫中,用戶可實現(xiàn)交互查詢和聯(lián)合分析不同層次組學數(shù)據(jù)等功能;數(shù)據(jù)庫將不斷完善,建立多層次組學間的整合分析和數(shù)據(jù)呈現(xiàn),并形成升級版本;數(shù)據(jù)庫提供歸屬不同通路的衰老相關基因集,使用戶可更深入全面地了解特定基因和通路在衰老生物學中的意義。Aging Atlas提供開放的數(shù)據(jù)共享平臺,用戶可在上傳界面進行原始數(shù)據(jù)和處理后數(shù)據(jù)的上傳操作,為實現(xiàn)全球數(shù)據(jù)共享提供便利。Aging Atlas的建立旨在為世界范圍內衰老相關大數(shù)據(jù)的統(tǒng)一匯交、集中存儲、安全管理、開放共享及前沿交叉研究和轉化應用提供助力。相關研究成果以Aging Atlas: a multi-omics database for aging biology為題,在線發(fā)表在Nucleic Acids Research上。
Aging Atlas數(shù)據(jù)庫首次實現(xiàn)對與衰老相關的不同層次的多組學數(shù)據(jù)的收錄和整合,其對用戶免費開放,且持續(xù)實時更新,將有助于推動衰老相關的基礎研究和臨床轉化應用的發(fā)展。Aging Atlas希望在廣大科學工作者的支持下,不斷吸納更多高質量的衰老研究數(shù)據(jù),以更好地服務衰老生物學和老年醫(yī)學的發(fā)展。
該數(shù)據(jù)庫由北京基因組所、動物所、中科院干細胞與再生醫(yī)學創(chuàng)新研究院、中科院干細胞與再生醫(yī)學科學數(shù)據(jù)中心、首都醫(yī)科大學宣武醫(yī)院等合作完成。數(shù)據(jù)庫的建設得到北京基因組所研究員楊運桂、慈維敏、任捷、韓大力,動物所研究員宋默識、周兵和副研究員馮桂海,中科院生物物理研究所所研究員陳暢,北京大學教授湯富酬教授、趙揚,浙江大學教授郭國驥和同濟大學教授尹曉磊的指導和支持。研究工作得到科技部、國家自然科學基金委、中科院和北京市等的資助。
Aging Atlas數(shù)據(jù)庫
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