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——習(xí)近平總書記在致中國科學(xué)院建院70周年賀信中作出的“兩加快一努力”重要指示要求

面向世界科技前沿、面向經(jīng)濟(jì)主戰(zhàn)場、面向國家重大需求、面向人民生命健康,率先實(shí)現(xiàn)科學(xué)技術(shù)跨越發(fā)展,率先建成國家創(chuàng)新人才高地,率先建成國家高水平科技智庫,率先建設(shè)國際一流科研機(jī)構(gòu)。

——中國科學(xué)院辦院方針

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昆明動(dòng)物所揭示溫泉菌群空間分布的特征參數(shù)

2019-05-27 昆明動(dòng)物研究所
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  生物分布的空間異質(zhì)性是生態(tài)學(xué)研究的核心問題之一;對于似乎無處不在的細(xì)菌來講,這一問題的研究難度似乎更大。近日,中國科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所計(jì)算生物與醫(yī)學(xué)生態(tài)學(xué)實(shí)驗(yàn)室博士生李連偉發(fā)表在Molecular Ecology上的論文揭示了溫泉菌群分布的重要特征參數(shù)。這是作者繼年初在Frontiers in Microbiology上發(fā)文試圖估計(jì)全球溫泉細(xì)菌種類理論最大值后,所獲得的另一項(xiàng)關(guān)于溫泉菌群生態(tài)的重要參數(shù)。兩項(xiàng)研究均基于Sharpe(2014)等所收集的全球160多組溫泉菌群宏基因測序數(shù)據(jù)。

  該研究最重要的發(fā)現(xiàn)是,菌群空間分布異質(zhì)性隨群落中平均物種大小變化的關(guān)系符合冪法則模型,而該冪法則模型的關(guān)鍵參數(shù)(b)是一常數(shù),并不受溫泉環(huán)境因子(例如溫度、pH)的影響。因此,利用這一常數(shù),就可以估計(jì)某一溫泉中菌群分布空間異質(zhì)性的高低。論文中,作者以地球上重力加速度常數(shù)(g=9.8)做類比,闡述了所發(fā)現(xiàn)參數(shù)的理論和實(shí)際意義。如果重力加速度不是常數(shù),則一個(gè)人在地球上不同地方體重可能會(huì)差別很大。而地球和月球具有不同重力加速度,才有了超重或失重現(xiàn)象。為此,作者對溫泉菌群和人類菌群作了嚴(yán)格統(tǒng)計(jì)學(xué)檢驗(yàn),發(fā)現(xiàn)兩者確實(shí)具有不同的異質(zhì)性參數(shù)。而溫泉菌群,無論其溫泉溫度或pH差別多大,其異質(zhì)性參數(shù)基本恒定。這一發(fā)現(xiàn)受到審稿人意大利Catania大學(xué)生態(tài)學(xué)系主任Christian Mulder的高度評(píng)價(jià)。

  該研究所采用的理論模型來自昆明動(dòng)物所研究員馬占山于2015年對Taylor 冪法則模型的四項(xiàng)擴(kuò)展。Taylor 冪法則由英國生態(tài)學(xué)家LR Taylor于1961年發(fā)表在Nature上, 其后幾十年中生態(tài)學(xué)家進(jìn)行了大量理論研究和野外種群生態(tài)學(xué)調(diào)查驗(yàn)證,成為研究生物種群空間分布最重要的理論方法之一,其應(yīng)用范圍從最早昆蟲種群空間分布研究擴(kuò)展到其它動(dòng)植物、寄生蟲、植物病蟲害分布,乃至超出生物學(xué)領(lǐng)域的研究(例如地震分布、Linux 操作系統(tǒng)內(nèi)核結(jié)構(gòu)、集成電路分析等)。馬占山先前所做的擴(kuò)展則是將Taylor冪法則從種群水平擴(kuò)展到群落水平的研究,特別是“群落空間分布異質(zhì)性”和“群落(時(shí)間)動(dòng)態(tài)穩(wěn)定性”的分析。例如有學(xué)者將其應(yīng)用于皮膚菌群動(dòng)態(tài)穩(wěn)定性的研究(Oh et al. 2016, Cell)。

  李連偉為文章的第一作者,馬占山為文章的通訊作者。

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打印 責(zé)任編輯:葉瑞優(yōu)

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