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加快打造原始創(chuàng)新策源地，加快突破關(guān)鍵核心技術(shù)，努力搶占科技制高點(diǎn)，為把我國建設(shè)成為世界科技強(qiáng)國作出新的更大的貢獻(xiàn)。

——習(xí)近平總書記在致中國科學(xué)院建院70周年賀信中作出的“兩加快一努力”重要指示要求

面向世界科技前沿、面向經(jīng)濟(jì)主戰(zhàn)場、面向國家重大需求、面向人民生命健康，率先實(shí)現(xiàn)科學(xué)技術(shù)跨越發(fā)展，率先建成國家創(chuàng)新人才高地，率先建成國家高水平科技智庫，率先建設(shè)國際一流科研機(jī)構(gòu)。

——中國科學(xué)院辦院方針

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【中國科學(xué)報(bào)】中國大豆“中黃13”基因組發(fā)布

為國產(chǎn)優(yōu)異大豆品種培育奠定基礎(chǔ)

2018-08-02 中國科學(xué)報(bào)

【字體：大中小】

語音播報(bào)

　　大豆起源于中國，古稱“菽”，約在5000年前由其野生種馴化而來，隨后廣泛傳播于世界各地。大豆在引種和改良過程中產(chǎn)生了遺傳瓶頸效應(yīng)，使來自不同主產(chǎn)區(qū)的大豆品種間具有顯著的遺傳變異。目前廣泛采用的大豆參考基因組來源于美國品種“Williams 82”。該單一品種的基因組并不能完全代表所有大豆的遺傳變異，特別是和美國地理距離遙遠(yuǎn)具有明顯遺傳變異的亞洲品種。此外，功能研究發(fā)現(xiàn)該基因組存在多處組裝錯(cuò)誤，影響了功能基因的定位挖掘。

　　合作團(tuán)隊(duì)綜合運(yùn)用單分子實(shí)時(shí)測序、單分子光學(xué)圖譜和高通量染色體構(gòu)象捕獲技術(shù)，分析得出“中黃13”基因組Contig N50為3.46 Mb，Scaffold N50為51.87 Mb，是目前連續(xù)性最好的植物基因組之一。進(jìn)一步分析，Gmax_ZH13和Williams 82基因組之間存在著大量的遺傳變異，包括1404個(gè)易位事件、161個(gè)倒位事件、1233個(gè)倒位易位事件，以及在Gmax_ZH13中出現(xiàn)的505506個(gè)小插入/缺失和17409個(gè)大插入/缺失。

　　該研究整合大量轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)為Gmax_ZH13基因注釋基因構(gòu)建了一個(gè)完整的基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)，得到26個(gè)可能控制大豆開花時(shí)間的基因，并利用自然群體遺傳變異和表型差異的關(guān)聯(lián)對其中部分基因進(jìn)行驗(yàn)證，為重要農(nóng)藝性狀基因的挖掘提供了新思路。Gmax_ZH13基因組的發(fā)表為大豆基礎(chǔ)研究提供了重要資源，為國產(chǎn)優(yōu)異大豆品種的培育奠定了基礎(chǔ)。

　　相關(guān)論文信息：DOI：10.1007/s11427-018-9360-0

　　（原載于《中國科學(xué)報(bào)》 2018-08-02 第1版要聞)

　　中科院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所聯(lián)合中國科技大學(xué)、江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院種質(zhì)資源與生物技術(shù)所、北京貝瑞和康生物技術(shù)有限公司等，對中國國審大豆品種“中黃13”（Gmax_ZH13）的基因組進(jìn)行從頭組裝，最終得到1.025 Gb的基因組序列，包含20條染色體和1條葉綠體。相關(guān)成果近日以封面文章形式在線發(fā)表于《科學(xué)中國—生命科學(xué)》。
　　大豆起源于中國，古稱“菽”，約在5000年前由其野生種馴化而來，隨后廣泛傳播于世界各地。大豆在引種和改良過程中產(chǎn)生了遺傳瓶頸效應(yīng)，使來自不同主產(chǎn)區(qū)的大豆品種間具有顯著的遺傳變異。目前廣泛采用的大豆參考基因組來源于美國品種“Williams 82”。該單一品種的基因組并不能完全代表所有大豆的遺傳變異，特別是和美國地理距離遙遠(yuǎn)具有明顯遺傳變異的亞洲品種。此外，功能研究發(fā)現(xiàn)該基因組存在多處組裝錯(cuò)誤，影響了功能基因的定位挖掘。
　　合作團(tuán)隊(duì)綜合運(yùn)用單分子實(shí)時(shí)測序、單分子光學(xué)圖譜和高通量染色體構(gòu)象捕獲技術(shù)，分析得出“中黃13”基因組Contig N50為3.46 Mb，Scaffold N50為51.87 Mb，是目前連續(xù)性最好的植物基因組之一。進(jìn)一步分析，Gmax_ZH13和Williams 82基因組之間存在著大量的遺傳變異，包括1404個(gè)易位事件、161個(gè)倒位事件、1233個(gè)倒位易位事件，以及在Gmax_ZH13中出現(xiàn)的505506個(gè)小插入/缺失和17409個(gè)大插入/缺失。
　　該研究整合大量轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)為Gmax_ZH13基因注釋基因構(gòu)建了一個(gè)完整的基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)，得到26個(gè)可能控制大豆開花時(shí)間的基因，并利用自然群體遺傳變異和表型差異的關(guān)聯(lián)對其中部分基因進(jìn)行驗(yàn)證，為重要農(nóng)藝性狀基因的挖掘提供了新思路。Gmax_ZH13基因組的發(fā)表為大豆基礎(chǔ)研究提供了重要資源，為國產(chǎn)優(yōu)異大豆品種的培育奠定了基礎(chǔ)。
　　相關(guān)論文信息：DOI：10.1007/s11427-018-9360-0
　?。ㄔd于《中國科學(xué)報(bào)》 2018-08-02 第1版要聞)

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