——習(xí)近平總書(shū)記在致中國(guó)科學(xué)院建院70周年賀信中作出的“兩加快一努力”重要指示要求
——中國(guó)科學(xué)院辦院方針
語(yǔ)音播報(bào)
DNA甲基化是一種重要的表觀遺傳修飾。以高等動(dòng)物為例,個(gè)體從受精卵發(fā)育成成體的過(guò)程中,DNA甲基化圖譜都是動(dòng)態(tài)變化的,會(huì)調(diào)控不同的細(xì)胞往不同的方向分化。因此,建立DNA甲基化圖譜對(duì)理解生殖細(xì)胞形成和胚胎發(fā)育至關(guān)重要。
在基金委“細(xì)胞編程和重編程的表觀遺傳機(jī)制”重大研究計(jì)劃中,中國(guó)科學(xué)院北京基因組研究所劉江課題組以斑馬魚(yú)為模型,發(fā)現(xiàn)了子代選擇性繼承父本而拋棄母本的DNA甲基化圖譜,從而揭開(kāi)從受精卵到個(gè)體發(fā)育之謎。
傳統(tǒng)觀點(diǎn)中,人們認(rèn)為早期胚胎發(fā)育主要由卵子決定,精子只提供一套DNA序列,不提供其他信息。為確切了解表觀遺傳信息的傳遞,劉江團(tuán)隊(duì)選取了與人類基因類似度高達(dá)85%的斑馬魚(yú)為實(shí)驗(yàn)對(duì)象,共測(cè)量斑馬魚(yú)卵子、精子、6個(gè)早期胚胎和精囊共9個(gè)時(shí)期的全基因組DNA甲基化序列,并利用品系間的單核苷酸多態(tài)性(SNPs)來(lái)區(qū)分DNA來(lái)源于父源還是母源。
研究發(fā)現(xiàn),斑馬魚(yú)受精后,子代繼承父源DNA的甲基化圖譜,而母源DNA的甲基化圖譜被拋棄,并重新編程變成精子的甲基化圖譜。進(jìn)一步功能分析發(fā)現(xiàn),斑馬魚(yú)子代胚胎繼承父代的甲基化圖譜可以調(diào)控基因的時(shí)序表達(dá),從而指導(dǎo)胚胎的早期發(fā)育。
該研究首次證明除DNA序列外,DNA甲基化圖譜也可以被完整地遺傳到子代中,這意味著在調(diào)控動(dòng)物發(fā)育、表型甚至疾病等方面,表觀遺傳信息的變異可能和遺傳信息的變異一樣起重要作用。
而哺乳動(dòng)物受精后,早期胚胎需要對(duì)來(lái)自父本與母本的表觀遺傳信息進(jìn)行全基因重編程才能完成早期發(fā)育,進(jìn)而發(fā)育成完整個(gè)體。受精后,需要父源DNA和母源DNA具有一樣的甲基化圖譜,但哺乳動(dòng)物使用了與斑馬魚(yú)完全不同的機(jī)制。
2014年,劉江課題組與南京大學(xué)模式動(dòng)物研究所黃行許課題組合作,發(fā)現(xiàn)在哺乳動(dòng)物早期發(fā)育過(guò)程中,作為表觀遺傳新標(biāo)志物的5-羥甲基胞嘧啶(5hmC)在父源與母源基因組中均存在。并且,基因組的DNA去甲基化并不是由5-甲基胞嘧啶(5mC)氧化產(chǎn)物介導(dǎo)的被動(dòng)稀釋而實(shí)現(xiàn)的,因此無(wú)論父源還是母源DNA都存在主動(dòng)去甲基化的方式。
此項(xiàng)發(fā)現(xiàn)改寫(xiě)了關(guān)于哺乳動(dòng)物早期胚胎發(fā)育過(guò)程中,5mC的氧化產(chǎn)物只存在父源基因組中,且母源基因組通過(guò)被動(dòng)稀釋去甲基化的認(rèn)識(shí)。
通過(guò)對(duì)哺乳動(dòng)物和魚(yú)類的進(jìn)化比較,劉江等人推測(cè)哺乳動(dòng)物全基因組特異的去甲基化過(guò)程為印記基因的產(chǎn)生提供了可能,從而使胎盤(pán)類生殖方式的哺乳動(dòng)物得以進(jìn)化出來(lái)。換言之,表觀遺傳重新編程方式的進(jìn)化,可能是產(chǎn)生胎盤(pán)生殖方式哺乳動(dòng)物的重要一環(huán)。
研究人員認(rèn)為,這些發(fā)現(xiàn)豐富了我們對(duì)表觀遺傳信息網(wǎng)絡(luò)起源與進(jìn)化的認(rèn)識(shí),使我國(guó)在早期胚胎發(fā)育表觀遺傳修飾重編程研究中處于國(guó)際領(lǐng)先水平。
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