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記者從中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所獲悉,日前科研團隊完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制,全面揭示了小麥A基因組的結(jié)構(gòu)和表達特征,對深入和系統(tǒng)研究麥類植物的結(jié)構(gòu)與功能基因組學(xué)以及進一步推動栽培小麥的遺傳改良具有重要理論意義和實用價值。研究成果于北京時間5月10日在國際學(xué)術(shù)刊物《自然》在線發(fā)表。
小麥是全球重要的糧食作物,養(yǎng)活了世界上40%的人口,提供了人類所需熱能和蛋白質(zhì)的20%。據(jù)科研人員介紹,生產(chǎn)上廣泛種植的普通小麥是一個經(jīng)兩次自然雜交而形成異源六倍體,含有A、B和D三個基因組,其基因組大(約17 Gb,是水稻基因組的40倍)而復(fù)雜,85%以上基因組DNA為重復(fù)序列,致使基因組測序研究困難重重,進展緩慢。追本溯源,烏拉爾圖小麥是普通小麥和其它多倍體小麥中A基因組的原始二倍體供體。因此,烏拉爾圖小麥在多倍體小麥進化過程中起著基礎(chǔ)性的核心作用。
研究團隊在前期小麥A基因組草圖繪制的基礎(chǔ)上,通過構(gòu)建A基因組BAC文庫和BAC測序,結(jié)合全基因組PacBio測序以及最新物理圖譜構(gòu)建技術(shù)(BioNano和10x Genomics),完成了烏拉爾圖小麥材料G1812的基因組測序和精細組裝,繪制出了小麥A基因組7條染色體的分子圖譜,注釋出了41,507個蛋白編碼基因,發(fā)現(xiàn)在小麥基因組中參與春化和開花的REM類轉(zhuǎn)錄因子基因有明顯擴增。通過與水稻、高粱和短柄草基因組的比較和共線性分析,推演出了小麥A基因組7條染色體的進化模型,并鑒定出小麥A基因組從二倍體、經(jīng)四倍體到六倍體進化過程中的染色體結(jié)構(gòu)變異。
科研人員指出,小麥A基因組測序和精細圖譜繪制的完成,為國內(nèi)外科研工作者解析小麥基因組進化和馴化提供了高質(zhì)量的基因組信息和一個全新的視角。注釋出的基因信息將助力小麥重要農(nóng)藝性狀基因的精細定位、克隆和功能解析,加速栽培小麥的遺傳改良和分子設(shè)計育種,對提升小麥產(chǎn)業(yè)競爭力、保障糧食安全和農(nóng)業(yè)提質(zhì)增效與可持續(xù)發(fā)展將產(chǎn)生重要作用。
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